本游戏的故事异于以往的系列作品，以往玩家熟悉的大魔王－库巴，在这次的剧情中居然也成了受害者。于是乎，马里奥为了救出老弟－路易，与碧姬公主和库巴组队冒险，打倒幕后真正邪恶的始作蛹者。

     在游戏中，玩家必须准确利用碧姬公主的“伞”来移动至马里奥无法到达的地方，亦必须使用库巴独门的“火球攻击”来清除道路上的敌人。另外，承袭 NDS 版《新超级马里奥》的新系统，马里奥与碧姬公主等吃下巨大香菇后会巨大化 10 秒钟，玩家可藉此快速清除画面上的敌人及障拟物。在游戏中，马里奥可藉由消耗体力发动“次元技”。这时原本 2D 的游戏舞台会转变为 3D 画面的游戏舞台，在体力尚未消耗完毕之前，马里奥可藉此在 3D 的冒险舞台上寻找隐藏的道路或道具，来继续推进游戏进度。

Wii版《超级纸片马里奥》预定售价为 5800 日元，对应玩家人数1人，喜欢马里奥的玩家不要错过本作。